集中空调通风系统的卫生状态直接关系到室内空气质量，影响人体健康。其产权单位、产权委托管理单位负责卫生管理。

清洗消毒后要进行检测，获得相关部门出具的卫生学检测、评价合格报告才算结束。“清洗前，要对清洗现场条件和通风系统安装条件进行分析，对污物组成和粘附力进行分析。通风系统严重污染时，还应提供积尘量、致病微生物、细菌、真菌的检测报告，以备清洗后做对比检测。 ”此外，清洗过程中分段作业，相对独立，防止导致二次污染和交叉污染。